每年5月前后是食叶害虫的高发期，害虫严重危害林业生态。区林业有害生物防控领导小组统筹推进全区林业有害生物防控工作，做到预防为主，防治为辅。 为阻断外来林木病害的传播，保障独山子绿色生态健康发展，区自然资源分局根据《植物检疫条例》《森林病虫害防治条例》等相关法律法规要求，从2019年起，依托各检查站，开展入独植物检疫工作，依法规范植物持证调运制度，外来植物及植物制品必须携带植物检疫证。截至目前，检疫入独植物及植物制品1200批次，共计900万余株。 
区自然资源分局持续加强重大病虫害调查，设置病虫害监测黑光灯16处，动员林业管护单位共同参与到病虫害监测工作中，加强管护单位兼职检疫员培训，确保及时发现病虫害发生发展规律，及时发布病虫害预测预报信息，指导区内各管护单位落实防治措施。 在灭虫方面，区自然资源分局推广生物防控措施及生物制剂农药，杜绝高毒农药的使用，采取在林内搭建鸟巢吸引益鸟入住的做法，针对外围林地引进无人机飞防等新型施药方法，从而达到精准防控、生态防控及减少农药整体使用量的目的。 区自然资源分局工作人员说，目前独山子整体林业生态较为脆弱，适生树种较少、水资源缺乏。为保障林业生态安全，杜绝外来有害生物入侵，区自然资源分局将继续加强病虫害监测，加大绿色防控措施推广力度，强化检疫执法联动机制，逐步织密林业有害生物防控网络，守护好独山子这一抹绿色屏障。 独山子城区四周有完善的防护林体系。截至2021年，全区林地总面积为1293公顷，为空气净化、改善环境，保持生态平衡，提升巩固园林城区奠定了坚实的基础，基本建成了城在林中的绿色生态格局。
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